茶樹est-ssr的信息分析與標記建立
發布時間：2024-08-31 點擊：64
在1589條茶樹est中，共發掘出了281個est-ssr，分布于246條est中，出現頻率是17．68％，平均長度為33．06bp，平均分布頻率是1，2．61kb。在茶樹est-ssr中，二核苷酸重復是主要的重復類型，出現最多的重復基元類型是ag／ct重復。設計了19對ssr引物，在對引物、dntp、mgcl2的濃度及退火溫度等參數進行測試后，建立了合適的pcr反應體系。以衍生絕大多數est-ssr的龍井43dna為模板，對引物進行了篩選，有16對引物顯示擴增，可用率為84．2％；進一步在10個茶樹品種中進行多態性測試，顯現出多態性的引物占可擴增引物的62．5％。本文研究結果證明了根據茶樹est建立ssr標記是有效、可行的。完成機構：[1]浙江大學原子核農業科學研究所,浙江杭州310029 [2]杭州市農業科學院,浙江杭州310024